Stasiun Matraman memiliki dua lantai pada bangunannya, pada lantai dasar Stasiun Matraman memiliki luas sebesar 354,25 meter persegi.
Lantai dasar Stasiun Matraman ini merupakan sebagai area layanan pengguna yang difasilitasi dengan adanya loket, gate elektronik masuk dan keluar area stasiun Matraman, toilet pria dan wanita, serta dilengkapi dengan toilet difabel.
Selain itu, Stasiun Matraman juga menyediakan fasilitas seperti Mushola, ruang kesehatan, ruang staff stasiun, dan ruang pelayanan barang tertinggal, serta area pelayanan pengguna lainnya yang dapat memudahkan pengguna moda transportasi KRL.
Pada lantai satu Stasiun Matraman yang dibangun dengan luas 588 meter persegi ini digunakan sebagai peron serta sebagai tempat tunggu dan naik KRL pada jalur 1 dan 2.
Selain itu, Stasiun Matraman juga dilengkapi dengan fasilitas tangga manual, escalator, lift untuk pengguna prioritas, dan juga tempat parkir untuk kendaraan bermotor.
Kemudian, Stasiun Matraman ini dilengkapi juga dengan adanya fasilitas CCTV, Alat Pemadam Api Ringan (APAR), sistem larm kebakaran, dan alat penangkal petir.
Mentri Koperasi dan UMKM Teten Masduki juga berharap fasilitas publik seperti stasiun Mantraman ini juga dapat menyediakan tempat usaha untuk pegiat UMKM.***